Dunkle Wolken hingen über Mugello, doch die vom Regenschauer während des 125er-Zeittrainings nasse Piste trocknete zum Qualifying der MotoGP weitgehend ab. Alle Piloten gingen früh mit Slicks auf die Piste, um eine flotte Runde hinzulegen. Nach zehn Minuten hatten alle 16 Teilnehmer drei bis vier schnellen Runden gefahren. Schnellster zu Beginn war Andrea Dovizioso (I/Repsol-Honda), der bereits am Freitag bei ähnlichen Bedingungen schnell unterwegs war. Wenig später schnappte sich aber Marco Simoncelli (I/Gresini-Honda) mit einer Zeit von 1.48,909 min die vorläufige Pole-Position. Der Stand nach 15 von 60 Minuten: Simoncelli, Lorenzo, Stoner, Dovizioso, Spies, Crutchlow, Pedrosa, Hayden, Barbera, Abraham, Rossi, de Puniet, Edwards, Elias, Bautista, Aoyama. Simoncelli legte weiter nach und verbesserte seine eigene Bestzeit um 0,4 sec, doch Assen-Sieger Ben Spies (USA/Yamaha) umrundete die Piste 6/1000 sec schneller als der Gresini-Pilot. Wohin die Reise aber gehen wird, machte nach 25 Minuten Casey Stoner deutlich: In 1.48,034 min brannte der Australier einen neuen Streckenrekord in den Asphalt! Während die Top-8 komplett von Honda und Yamaha dominiert werden, bekommen die Ducati-Piloten auf ihrer Heimstrecke ordentlich einen auf die Mütze. Bester Ducati-Pilot ist bei Trainingshalbzeit Nicky Hayden (USA) auf Position 9. Valentino Rossi belegt gar nur den 12. Rang - 1,9 sec langsamer als sein Vorgänger Casey Stoner, der mit der Repsol-Honda souverän auf Platz 1 steht. Von der letzten Position wird Toni Elias (E/Honda) ins Rennen gehen.